磨头镇位于如皋板块正中心，是主城区的卫星镇，主城区、国家级经济开发区、省级高新区三面环抱。磨头镇总面积102.8平方公里，总人口8.45万人。镇区建设总用地8.79平方公里，规划总用地15.53平方公里。

下辖磨头社区、邓高社区、天阳社区、高庄社区、新联社区、丁冒村、星港村、新徐村、严狄村、兴韩村、高李村、顾沈村、朗张村、老户村、董堡村、曹石村、场东村、场西村、塘湾村、新港村、十字桥村，共16个行政村，5个居委会。