2016年年末，如皋市辖1个国家级经济技术开发区（如皋经济技术开发区）、1个省重点工业园区（如皋港区）、1个省高新技术产业开发区（如皋高新技术产业开发区）和如皋工业园区，如城、城南、城北3个街道办事处和东陈、丁堰、白蒲、下原、九华、石庄、吴窑、江安、搬经、磨头、长江11个镇。城北街道与如皋经济技术开发区、城南街道与如皋高新技术产业开发区、如城街道与如皋工业园区实行“以区带街、区街合一”管理机制，长江镇与如皋港区实行“镇区合一”管理体制。全市村（居）347个，其中居委会181个、村委会166个。