一、办公室

负责处理机关行政事务和系统党建、组织人事、宣传、教育工作。负责政务信息收集整理，文稿起草、审核、收发、组织起草重大综合性报告和总结材料；负责来人接待和总务、后勤服务管理；负责离退休干部服务工作；负责劳动工资、社会保障和文书、人事档案管理工作；组织承办机关、事业单位工作人员年度考核、评比、奖惩。

二、财务资产科

负责所属单位财务和资产管理工作。负责系统的财务指导、协调、服务、管理和监督；负责编制机关收支预算和政府下达预外资金的收缴；负责全系统会计、统计报表的汇总和财务、统计分析工作；负责社员股金的清理、整顿和管理工作；承办资产评估、重组、租赁、转让的有关事项；负责机关物业管理。

三、监察审计科

负责所属单位的纪检、监察、审计和来信来访工作。负责本系统党员干部党纪、政纪、法纪教育和违法、违纪案件的查处工作；指导全系统学法、用法、守法，开展警示教育，加强行风建设；负责系统内部财务审计、企业负责人任期及离任审计、改制清盘审计和政府指定的专项审计。

四、市场指导科

负责全系统的为农服务工作，积极参与社会主义新农村建设。指导企业积极做好农药、化肥和种子的供应工作，协助净化农业投入品市场；负责构建农村现代连锁经营服务网络，对兴办为农综合服务社进行指导、协调和服务；负责指导农民合作经济组织和农副产品生产基地的建设，扩大农副产品购销，参与推动农业产业化。

五、综合管理科

负责所属企业改革和开放办社的指导工作，提供政策协调服务；负责系统内工业企业技改、新产品开发、产品质量、计量设备、环保、节能等管理；负责安全生产、保险、创建、考核评比、综合治理工作；负责全系统外经、外贸、招商引资的组织协调及项目立项核批上报工作；负责系统内集体商业的指导、协调、监督和管理工作。